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XBB毒株------阿伟百科

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发表于 2025-4-5 13:17:41 来自手机 | 显示全部楼层 |阅读模式
XBB亚型毒株是严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2奥密克戎变异株的BA.2.10.1(BJ.1)亚型毒株与BA.2.75(BM.1.1.1)亚型毒株两个毒株重组而成的新毒株[1],于2022年9月12日首先被美国疾控中心上报。[2]
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:18:35 来自手机 | 显示全部楼层
病毒的出现与爆发
XBB病毒首先在2022年10月于新加坡和印度爆发[3],随后迅速进入美洲地区以及世界其他地区国家相继爆发,并在世界各国演化出适应各国环境的毒株。随后世界卫生组织相继对XBB*、XBB.1.5*、XBB.1.9.1*、XBB.1.9.2*、XBB.1.16*、XBB.2.3*,EG.5*列入重点监测毒株。[4]由于XBB的家族增长满足提升主枝条件,被提升为主枝22F。
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:33:35 来自手机 | 显示全部楼层
根据PANGOLIN平台的记录,XBB亚型的后代已经有77种之多。[5]在这77种后代中,已经有部分后代被世界卫生组织重点监测。受限于PANGOLIN平台对于数据公布的滞后,实际上的已指定的后代约900余种。
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:37:24 来自手机 | 显示全部楼层
XBB.1家族
其后代中很多具有增益比较快的毒株大多都是XBB.1的后代。其他不属于以下列出的任何家族的毒株且需要关注的毒株。

XBB.1.17.1的后代GA.4,GA.6.1,GA.4.1。
XBB.1.18.1以及后代FE.1,FE.1.1.2。
XBB.1.19.2,带有S521S突变的毒株。
HB.1,带有热门趋同突变S:F456L突变的毒株。
HE.1,第一个第七代XBB毒株,带有S:V622I突变和一个ORF8突变的毒株。
XBB.1.49,带有S:346S和S:486P突变的毒株。
XBB.1.12.1,带有S613H和S:E1202Q突变的毒株。
XBB.1.42.1,带有S:478R突变的毒株。
XBB.1.41.1是带有S:478R突变的毒株。其后代被分配JC谱系,JC.1是带有S:K77R突变的毒株。XBB.1.41.2是带有S:S494P突变的毒株。
GA.4.1.1是带有S675H突变的毒株。
JW.1是带有S:K478R突变和一个ORF1a突变的毒株。
FE.1.1.5是带有S:E554K突变的毒株。
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:39:18 来自手机 | 显示全部楼层
XBB.2以及XBB.2.3家族
XBB.2和XBB.1一样,是一个具有一定规模的血统,但是和XBB.1相比,XBB.2的规模要小很多,XBB.2是在其XBB的基础上获得了S253G突变的,其后代中有两个获得了S613H突变的XBB.2.2和XBB.2.12,以及获取了S52H突变的XBB.2.10,以及获取了两个核苷酸突变的XBB.2.6,以及获得了S521S突变S:S486P突变的XBB.2.3以及其家族。

XBB.2.3家族
XBB.2.3家族在近期引起了世界中一些国家的疫情形势变化。世界卫生组织在近期将其列入监测体系,于2023年8月提升主枝23E。

XBB.2.3家族的一些重点变异毒株。
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:42:27 来自手机 | 显示全部楼层
GE.1是XBB.2.3.10获取了S:K478R突变的毒株
XBB.2.3.2是XBB.2.3获取了S:G184V和一个ORF1a突变的毒株
XBB.2.3.3是XBB.2.3获取了S:182N突变的毒株,其后代GJ.1.1获取了S:A222V,N:R319H和一个ORF1a的突变。
XBB.2.3.8和XBB.2.3.11都是获取了S:478R突变的毒株,XBB.2.3.8还额外获得了一些小突变。XBB.2.3.11的后代GS.1获得了一些S:213D突变以及其他一些突变的毒株。
XBB.2.3.12是获得了S:S494P突变的毒株。
GZ.1是获得了S:F186L突变的毒株。
GJ.1.2.1是获得了S:N450D突变的毒株。
JA.1,是获得了S:F456L突变的毒株。
GE.1.1,是获得了S:E554K突变的毒株。
JE.1,是获得了S:478R突变的毒株。
JU.1,是获取了S:N450D突变,S218R突变和S:N148T突变的毒株。
XBB.2.3.16,是获取了S:K478N突变的毒株。
XBB.2.3.17,是获取了S:N450D突变的毒株。
XBB.2.3.18,是获取了S:F456L突变,S:N450D突变和S:1231A突变的毒株。
XBB.2.3.19,是获取了S:G184V突变的毒株。JY.1,是获取了S:E654K突变和S:K478T(回复突变)突变的毒株。
近期重点变异毒株监测信息,近期在监测中的XBB.2.3家族毒株有GE.1,GJ.1.2。
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:43:57 来自手机 | 显示全部楼层
XBB背景下的可能的趋同突变
XBB背景下的趋同突变主要在尖峰趋同突变,和非尖峰趋同突变。XBB下的非尖峰趋同突变主要集中在ORF1a,ORF3a,ORF3b,ORF7a,ORF7b,ORF8,ORF9a,ORF9b附近。尤其是XBB.1.16家族更容易在非尖峰突变区域产生突变,有关人员需要引起重视。

XBB背景下尖峰突变中的可能的趋同突变
XBB背景下的当前阶段正在流行的趋同突变可能包含以下突变:
S521T,S521S,S:K478R,S:F456L,S455F,S621S,S621T,S:N481K,S455W,S:A475V,S:N450D,S:F157L[10],S14H,S52H,S:S704L,S:A701V,S:K356T,S:K356Q,S:E554G,S:E554Q,S:E554K,S561S,S:T883I,S:T732I,S:T76I,S14K,S14R,S:N556K,S:E156Q,S:N185S,S:N185D,S:G184V,S:G184S,S:G181A,S:T572I,S:T573I,S146K,S:S256L,S:G482S,S954Y,S677H,S:T678I,S675H,S:F490P,S:E554D,S215H,S215V,S:A222V,S:T523N,S:E583A,S:K304N,S:E654Q,S:K304Q,S809S,S809T,S809L。

XBB背景下的已经流行过的趋同突变可能包含以下突变:
S:S486P,S:R403K,S:R403S,S613H,S:K478N,S:K147E,S:K147N

温馨提醒:由于信息来源广泛,很多信息来自不同信源,所以以上趋同突变的信息不能完全保证其准确性,仅供参考使用。

XBB背景下其他区域的可能的趋同突变
ORF1b:K2557R
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:46:05 来自手机 | 显示全部楼层
XBB.2.7.1
XBB.1.42.1*
JW.1(属于XBB.1.41.3家族)
XBB.1.41.1*
HB.1(属于XBB.1.34.2家族)
XBB.1.31*
XBB.1.27
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:47:08 来自手机 | 显示全部楼层
JC.3(属于XBB.1.41.1家族)₤
FW.1*(属于XBB.1.28家族)
HU.1*(属于XBB.1.22家族)$
FY.4.1.1(属于XBB.1.22家族)
XBB.1.19.2(属于XBB.1.19家族)
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 楼主| 发表于 2025-4-5 13:50:48 来自手机 | 显示全部楼层
注:除S:521以外的S:520_529区域内的突变标注$符号,除S:621以外的S:620_629区域内的突变标注€符号,除S:701和S:704以外的700_709区域内的突变标注₤符号。
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